125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10671 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  100 
 
 
238 aa  447  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  42.36 
 
 
238 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  44.73 
 
 
280 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  27.22 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  29.49 
 
 
453 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  38.67 
 
 
453 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  26.32 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  46.91 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  26.84 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  29.87 
 
 
448 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  35.11 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  29.87 
 
 
448 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  30.14 
 
 
420 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09730  CAAX amino terminal protease family  30.87 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648802  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  39.44 
 
 
453 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  28.1 
 
 
452 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  30.26 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  40.4 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  32.1 
 
 
130 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  33.33 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  26.63 
 
 
527 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  37.08 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  41.38 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  26.63 
 
 
527 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  25.9 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  28.85 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  30 
 
 
527 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  36.78 
 
 
319 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  23.93 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  24.64 
 
 
249 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  34.12 
 
 
538 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
282 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  23.73 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  32.1 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  32.1 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  32.1 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  32.1 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  34.44 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  30.86 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  33.33 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  26.06 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  26.06 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31340  predicted metal-dependent membrane protease  42.62 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249582  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  34.52 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  29.52 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
249 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  30.53 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  28.28 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl564  CAAX amino terminal membrane bound protease  22.68 
 
 
330 aa  47  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00292167  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  34.08 
 
 
289 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  29.55 
 
 
338 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
140 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  28.37 
 
 
203 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  28.37 
 
 
203 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  28.28 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0136  hypothetical protein  26.22 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  34.38 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  28.37 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  28.46 
 
 
775 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  30.14 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1134  abortive infection protein  29.52 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000223923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  38.04 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  38.04 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  28.37 
 
 
203 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  27.66 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  25.47 
 
 
337 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  34.18 
 
 
282 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  25.47 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  25.47 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  34.48 
 
 
528 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  34.18 
 
 
282 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  24.72 
 
 
176 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  26.63 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  31.03 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  34.21 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  29.27 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  21.52 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  28.03 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  27.07 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  21.52 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  24.53 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  21.52 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  21.52 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  25.49 
 
 
337 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  24.53 
 
 
337 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  21.52 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  24.53 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  36.45 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  24.67 
 
 
346 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  26.62 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1625  abortive infection protein  25 
 
 
414 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5434  Abortive infection protein  33.71 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  0.0723746 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  29.35 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  24.76 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3231  abortive infection protein  26.8 
 
 
267 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>