81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2280 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  100 
 
 		 269 aa  527  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  82.48 
 
 		 262 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  48.71 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  32.49 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  35.57 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  30.93 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  40.86 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  34.65 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  37.63 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  32.63 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  42.35 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  27.61 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  29.59 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  23.56 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  34.44 
 
 		 301 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  25.17 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  34.04 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  30.05 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  25.17 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  25.17 
 
 		 337 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  30.53 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  29.36 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  25.17 
 
 		 337 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  33.02 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  31.34 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  29.01 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  29.01 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  29.01 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  27.56 
 
 		 602 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  24.72 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  29.01 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  24.49 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  29.38 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  24.49 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  33.72 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  33.72 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  23.38 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  24.49 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  31.37 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  34.04 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  28.4 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  28.21 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  41.03 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  35 
 
 		 246 aa  45.4  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  34.04 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  29.57 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  37.5 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  37.5 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0273  Abortive infection protein  32 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  29.2 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  39.74 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  33.67 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  21.23 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  27.45 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1585  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  27.93 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  33.71 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  29.6 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  29.82 
 
 		 432 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  30.93 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  31.65 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  31.18 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  28.22 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  31.97 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  32.58 
 
 		 419 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  31.43 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  32.33 
 
 		 480 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  32.38 
 
 		 187 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  21.03 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  28.35 
 
 		 176 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>