34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4058 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  100 
 
 		 419 aa  790    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  38.11 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  35.81 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  37.13 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  32.58 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  33.09 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  33.67 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  41.59 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  33.18 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  31.31 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  31.85 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  30.95 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  31.89 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  33.64 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  27.24 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  31.82 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  32.86 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  30.16 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4640  abortive infection protein  41.25 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  34.65 
 
 		 293 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  41.41 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  31.11 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  35.87 
 
 		 227 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  36.04 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  39.17 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  38.54 
 
 		 288 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  25.83 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  37.35 
 
 		 140 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  34.38 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  27.81 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  37.5 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  28.04 
 
 		 322 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  30.14 
 
 		 285 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>