17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0269 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  100 
 
 		 309 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  65.61 
 
 		 312 aa  358  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  64.36 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  60.63 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  28.76 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  30.8 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  31.4 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  35.17 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  32.18 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  29.49 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  33.96 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  27.6 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  32.5 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  29.15 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  35.4 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  31 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  28.85 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>