53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3335 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  100 
 
 		 330 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  34.01 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  33.04 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  33.33 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  32.83 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  34.63 
 
 		 419 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  36.42 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  36.42 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  33.33 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  29.22 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  32.26 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  32.35 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  41.49 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  29.96 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  36.49 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  22.92 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  29.75 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  36.17 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  30.17 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  31.25 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  36 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  25.47 
 
 		 225 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  29.49 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  28.85 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  30.77 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  31.96 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  30.77 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  31.96 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  28.85 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  25.5 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  34.69 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  33.09 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  30.77 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  32.85 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  33.09 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  34.69 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  34.69 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  31.96 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  29.91 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  31.76 
 
 		 528 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  32.85 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  40.45 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  32.85 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  32.85 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  32.85 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  31.75 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  28.29 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  37.18 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>