22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2161 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  100 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  57.99 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  45.21 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  31.92 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  35.26 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  31.02 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  34.62 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  30.61 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  25.1 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  36.17 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  38.74 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  29.32 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  25.44 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5786  Abortive infection protein  36 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  26.37 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  26.78 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  37.78 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  35.16 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  36.08 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  25.53 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  28.04 
 
 		 182 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>