101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3181 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  49.83 
 
 
289 aa  298  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  41.73 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  33.33 
 
 
286 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  42.26 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  41.1 
 
 
282 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  44.74 
 
 
278 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  38.66 
 
 
273 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  43.75 
 
 
296 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  38.25 
 
 
281 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  36.86 
 
 
278 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  35.44 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  34.11 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  35.4 
 
 
305 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  31.88 
 
 
298 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  31.02 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  30.92 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  34.31 
 
 
325 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  30.92 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  28.12 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  32.69 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  32.85 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  32.69 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  33.99 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  31.88 
 
 
233 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  30.66 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  31.8 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  39.53 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  28.35 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  33.77 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  28.95 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  30.26 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  35.07 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  31.97 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  29.36 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  32.39 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  30.51 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  30.51 
 
 
376 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  30.51 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  30.51 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  30.51 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  30.51 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  27.65 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  29.94 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  30.83 
 
 
433 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  33.67 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  25.1 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  29.08 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  25.76 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  29.36 
 
 
260 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  34.13 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  26.64 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  28.4 
 
 
286 aa  49.3  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  32.18 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  29.17 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  30.95 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  30.95 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  29.17 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31340  predicted metal-dependent membrane protease  53.85 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249582  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  33.03 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  31.03 
 
 
237 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  38.46 
 
 
241 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  39.56 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  35.8 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  27.55 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  33.75 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  28.42 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  28.12 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0062  abortive infection protein  31.25 
 
 
290 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  24.69 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  31.11 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48029  predicted protein  34.18 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  36.7 
 
 
527 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  36.7 
 
 
527 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  31.68 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  31.25 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  32.58 
 
 
225 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  40.82 
 
 
198 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  33.33 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  47.92 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  31.19 
 
 
432 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  37.62 
 
 
448 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 
203 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  29.89 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  32.95 
 
 
225 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3040  hypothetical protein  34.78 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000131903  normal  0.41258 
 
 
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  37.62 
 
 
448 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  30.21 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  36.79 
 
 
204 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5786  Abortive infection protein  34.94 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  33.64 
 
 
775 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>