23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 		 339 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  31.94 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  33.21 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  31.25 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  31.71 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  41.35 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  36.4 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  29.19 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  30.8 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  28.15 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  29.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  35.42 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  29.79 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  31.09 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  29.5 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  27.81 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  37.27 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  28.45 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  28.28 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  31.63 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  32.93 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  32.93 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  28.36 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>