18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3886 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  100 
 
 		 402 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  41.27 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  34.23 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  36.33 
 
 		 301 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  27.63 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  30.24 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  36.14 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  29.17 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  34.91 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  30.52 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  29.31 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  35.75 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  32.31 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  32.35 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  27.46 
 
 		 320 aa  49.7  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  26.24 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  24.1 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  25.74 
 
 		 319 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>