26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0825 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  100 
 
 
342 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  39.93 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  38.13 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  34.19 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  37.29 
 
 
330 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  35.69 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  34.93 
 
 
402 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  33.21 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  30.2 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  41.25 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  30.13 
 
 
312 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  31.58 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  32.7 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  43.18 
 
 
419 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  29.89 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  28.79 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  28.08 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  25.13 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  33.94 
 
 
319 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  29.61 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  34.78 
 
 
255 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  29.79 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  22.66 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  23.68 
 
 
317 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  33.33 
 
 
246 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  35.29 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>