83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0359 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  100 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  34.9 
 
 
299 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  34.5 
 
 
321 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  31.86 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  36.56 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  27.04 
 
 
322 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  44.94 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  35.33 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  27.98 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.69 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  43.33 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  28.02 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  33.33 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  31.01 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  30.59 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  37.21 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  29.01 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.48 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  33.01 
 
 
176 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  28.47 
 
 
432 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  34.58 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  26.42 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  34.07 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  34.65 
 
 
255 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  26.11 
 
 
221 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  22.88 
 
 
346 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  25.81 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  25.63 
 
 
237 aa  49.3  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  24.74 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  35.63 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1544  abortive infection protein  33.62 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000980849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1789  hypothetical protein  31.08 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  31.97 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  24.21 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  24.74 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  24.21 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  24.21 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  24.21 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  37.35 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  26.22 
 
 
527 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  26.22 
 
 
527 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  24.21 
 
 
337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  24.21 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  26.56 
 
 
194 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  34.41 
 
 
225 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  24.08 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 
225 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  37.18 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4926  Abortive infection protein  35.23 
 
 
198 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.866905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
225 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
225 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  29.55 
 
 
226 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  26.58 
 
 
292 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 
203 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  33.68 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  32.93 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  29.91 
 
 
193 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 
480 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  32.23 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  32.93 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  32.93 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  26.85 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  32.93 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  32.93 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  23.68 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  38.55 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  26.85 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  32.23 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  32.23 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  32.93 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  31.31 
 
 
528 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  33.7 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  30.89 
 
 
775 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  38.46 
 
 
272 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  31.75 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  27.27 
 
 
197 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  29.57 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  27.27 
 
 
197 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  29.75 
 
 
196 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  29.57 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  40.24 
 
 
453 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>