49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0565 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  100 
 
 
193 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  79.69 
 
 
194 aa  282  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  62.76 
 
 
200 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  64.21 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  64.21 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  63.3 
 
 
196 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  60.53 
 
 
195 aa  222  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  52.22 
 
 
193 aa  180  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92863  predicted protein  39.56 
 
 
218 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212635  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  28.26 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  29.2 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4926  Abortive infection protein  31.48 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.866905 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  52.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  25.13 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  29.41 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  29.41 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  29.41 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  31.17 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  28.24 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  29.41 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  27.19 
 
 
308 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  23.96 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 
308 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.63 
 
 
292 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0437  Abortive infection protein  26.2 
 
 
189 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  32.24 
 
 
515 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  30.21 
 
 
299 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  32.88 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  29.91 
 
 
306 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  29.94 
 
 
528 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  26.67 
 
 
242 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  40.26 
 
 
277 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  23.78 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.58 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  28.07 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  33.8 
 
 
453 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  27.81 
 
 
288 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2896  Abortive infection protein  40.51 
 
 
279 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.142954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  25.29 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  35.37 
 
 
321 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  29.91 
 
 
311 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  27.61 
 
 
256 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  36.14 
 
 
198 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  34.57 
 
 
273 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  33.72 
 
 
317 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  38.71 
 
 
244 aa  41.2  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>