83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0390 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  100 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  48.01 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  49.36 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1789  hypothetical protein  58.8 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00196901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  46.64 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  40.2 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  38.44 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  27 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.24 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  33.07 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  33.64 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  35.65 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  27.27 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.56 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  41.98 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  37.35 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  41.79 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  27.31 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  31.62 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  24.23 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  26.85 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  27 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  36.26 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  29.66 
 
 		 775 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  31.16 
 
 		 527 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  31.16 
 
 		 527 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  37.31 
 
 		 528 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  36.05 
 
 		 196 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  35.16 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  35.82 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  30.25 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  31.25 
 
 		 197 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  31.25 
 
 		 197 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  38.81 
 
 		 515 aa  49.3  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  36.79 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  25.13 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  32 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  34.78 
 
 		 527 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  34.62 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  34.78 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  32.97 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  26.55 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  37.14 
 
 		 511 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  30.84 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  35.05 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  32.31 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  31.4 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  26.36 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5434  Abortive infection protein  32.94 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  0.0723746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  40.79 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  32.35 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  30.21 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  33.33 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1358  Abortive infection protein  34 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.098484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1269  abortive infection protein  35.16 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  24.23 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  30.77 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  35.11 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  28.36 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2591  abortive infection protein  34 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.965098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  26.74 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1257  Abortive infection protein  34 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  28.33 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  36.45 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  36.45 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  32.35 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  24.56 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  29.09 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  31.25 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  30.89 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0525  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.315028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  29.84 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  33.33 
 
 		 226 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  27.08 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2082  Abortive infection protein  30.88 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  32.11 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  38.67 
 
 		 448 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  23.85 
 
 		 221 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  38.67 
 
 		 448 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>