48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0019 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  40.35 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  30.95 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  36.7 
 
 
299 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  35.14 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  31.49 
 
 
322 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  29.18 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  42.53 
 
 
241 aa  79  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  29.73 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  28.33 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  33.96 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  36.36 
 
 
362 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  27.08 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  28.48 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  27.62 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  29.58 
 
 
317 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  37.35 
 
 
232 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  33.98 
 
 
227 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  31.18 
 
 
187 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  31.18 
 
 
187 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  31.18 
 
 
187 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  32.67 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  27.62 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 
188 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 
170 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  35.9 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  34.44 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 
187 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  23.53 
 
 
264 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2976  abortive infection protein  35.63 
 
 
1094 aa  45.8  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.292884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  29.67 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  24.59 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4926  Abortive infection protein  36.05 
 
 
198 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.866905 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  34.48 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  34.48 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  31.87 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  36.05 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  29.1 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  33.72 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  25.81 
 
 
187 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  21.55 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  22.1 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  29.25 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  26.88 
 
 
188 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3241  Abortive infection protein  31.19 
 
 
224 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>