96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1107 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  100 
 
 
340 aa  691    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  42.11 
 
 
333 aa  250  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  40 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
273 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  25.32 
 
 
256 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.46 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  30.56 
 
 
420 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  33.77 
 
 
237 aa  56.6  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  33.1 
 
 
448 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  33.1 
 
 
448 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  39.33 
 
 
264 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  29.33 
 
 
247 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  29.33 
 
 
247 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  45.35 
 
 
285 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  35.8 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  28.67 
 
 
480 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  32.28 
 
 
227 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  35.35 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  27.66 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  27.66 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  27.66 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  27.66 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  27.66 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  28.03 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  38.55 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  28.37 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  37.5 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  32.28 
 
 
227 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  30 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29.3 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  35.23 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  28.68 
 
 
538 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  28.46 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  42.31 
 
 
527 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  42.31 
 
 
527 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  25.74 
 
 
249 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  32.26 
 
 
227 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  24.82 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  40 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  29.58 
 
 
453 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  27.5 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  29.55 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  32.03 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0189  Abortive infection protein  35.96 
 
 
212 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0257996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  36.47 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  28.5 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  38.55 
 
 
234 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  34.62 
 
 
313 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  29.11 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  31.25 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0331  Abortive infection protein  38.81 
 
 
262 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0520111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  35.53 
 
 
221 aa  47  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  32.56 
 
 
420 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  32.91 
 
 
225 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  35.9 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  35.9 
 
 
337 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  28.57 
 
 
225 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  34.62 
 
 
313 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  27.93 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  34.62 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  31.43 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  32.5 
 
 
521 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  27.85 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  28.15 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  33.75 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  34.62 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  36.71 
 
 
284 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  27.36 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  30.93 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  34.62 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  32.05 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  34.62 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  26.02 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  34.62 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  26.56 
 
 
528 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  28.74 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0273  Abortive infection protein  31 
 
 
166 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  31.01 
 
 
452 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  32.05 
 
 
226 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  30.77 
 
 
220 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  36.05 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  28.95 
 
 
215 aa  43.5  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  26.83 
 
 
130 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0071  protease  34.52 
 
 
156 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  33.77 
 
 
346 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  34.62 
 
 
515 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  27.22 
 
 
284 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>