132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1085 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
130 aa  243  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  74.62 
 
 
256 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  39.51 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  38.16 
 
 
237 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  38.16 
 
 
227 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  37.08 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  38.16 
 
 
237 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  38.16 
 
 
288 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  31.4 
 
 
246 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  34.26 
 
 
237 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  33.33 
 
 
261 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  35.53 
 
 
237 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  32.69 
 
 
399 aa  53.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  31.4 
 
 
453 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  34.15 
 
 
234 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  33.77 
 
 
221 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  36.49 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  35.14 
 
 
527 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  35.14 
 
 
527 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 
249 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 
249 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  32.89 
 
 
253 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  32.89 
 
 
249 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 
235 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 
249 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  33.72 
 
 
273 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  30.23 
 
 
251 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  33.33 
 
 
249 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  28.05 
 
 
228 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 
249 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  32.14 
 
 
249 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  31.58 
 
 
238 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  32.14 
 
 
249 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  36.25 
 
 
264 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 
273 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4711  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
237 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0300594  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  35.14 
 
 
287 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  28.92 
 
 
241 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4727  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
237 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.972237  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  31.65 
 
 
453 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5145  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
237 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  28.7 
 
 
278 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  29.07 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  29.55 
 
 
225 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0331  Abortive infection protein  33.87 
 
 
262 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0520111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5144  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  29.76 
 
 
337 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  31.87 
 
 
227 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  28.24 
 
 
346 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  28.57 
 
 
313 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  27.37 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  32.43 
 
 
250 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1192  abortive infection protein  27.37 
 
 
206 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0143958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 
267 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  28.57 
 
 
337 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  33.33 
 
 
267 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.93 
 
 
297 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  28.05 
 
 
337 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  28.57 
 
 
337 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  29.55 
 
 
237 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  28.05 
 
 
337 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  28.57 
 
 
337 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  34.21 
 
 
453 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  26.97 
 
 
234 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  29.27 
 
 
521 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  29.55 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  29.03 
 
 
282 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  28.57 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  29.55 
 
 
237 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  28.57 
 
 
313 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  29.73 
 
 
528 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 
240 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  28.41 
 
 
244 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.76 
 
 
319 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  28.05 
 
 
337 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  27.38 
 
 
337 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  29.63 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  31.71 
 
 
246 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  29.63 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  25.58 
 
 
480 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  30.93 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  28.75 
 
 
237 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  29.63 
 
 
224 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  25.68 
 
 
538 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_002620  TC0525  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  43.9  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.315028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  27.71 
 
 
236 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  27.71 
 
 
236 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  27.71 
 
 
236 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  22.89 
 
 
211 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  30.11 
 
 
260 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  26.83 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  30.86 
 
 
244 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  21.43 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  27.03 
 
 
452 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  37.1 
 
 
527 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>