173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2823 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  35.16 
 
 
280 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  35.37 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  34.06 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  41.24 
 
 
362 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  35.71 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  37.9 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  31.43 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  32.79 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  27.98 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  31.43 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  33.02 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  38.71 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  40.51 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  30.95 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.43 
 
 
337 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  42.17 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.43 
 
 
337 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.43 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  42.17 
 
 
237 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  31.62 
 
 
228 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  30.71 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  38.55 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  30.71 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  28.67 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  40 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  30.88 
 
 
228 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  30.88 
 
 
228 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  30.88 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  30.88 
 
 
228 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.58 
 
 
234 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 
480 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.09 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  30.99 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  31.65 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  32.43 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  34.69 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  34.44 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  38.55 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  34.69 
 
 
236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  34.69 
 
 
236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  37.35 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  34.69 
 
 
236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  33.7 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  31.46 
 
 
224 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  35.63 
 
 
234 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  35.71 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  24.74 
 
 
321 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  39.56 
 
 
288 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  28.28 
 
 
432 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  34.26 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  37.04 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  32.58 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  37.04 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  37.04 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  32.53 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  38.46 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  34.94 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  36 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  34.57 
 
 
528 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  27.61 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  28.83 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  33.33 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  33.72 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  37.36 
 
 
237 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  37.36 
 
 
227 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  29.21 
 
 
237 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  34.07 
 
 
527 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  34.07 
 
 
527 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  32.29 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  31.13 
 
 
225 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  38.1 
 
 
287 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  27.61 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  35.45 
 
 
343 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  37.74 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  31.46 
 
 
420 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  28.43 
 
 
538 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  29.23 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  36.26 
 
 
237 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  35.23 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  32.53 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  36.47 
 
 
196 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  27.95 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  30.59 
 
 
448 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  30.59 
 
 
448 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  25.44 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  36.14 
 
 
453 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  26.06 
 
 
399 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  33.73 
 
 
775 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  34.52 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2845  Abortive infection protein  36.59 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.957668  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  32.61 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  37.17 
 
 
830 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  32.58 
 
 
453 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  26.21 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  33.64 
 
 
521 aa  49.3  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>