157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5134 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  35.16 
 
 
297 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  45 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  35.04 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  35.2 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  42.11 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  35.25 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  43.37 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  36.84 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  34.23 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  30.77 
 
 
432 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  34.86 
 
 
830 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.29 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  41.12 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  31.78 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  31.29 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  31.72 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.63 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  31.05 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  25.25 
 
 
237 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  30.34 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  34.83 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  28.63 
 
 
480 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  39.24 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  24.88 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  43.9 
 
 
528 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  41.86 
 
 
538 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  43.33 
 
 
527 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  43.33 
 
 
527 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  37.66 
 
 
338 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  26.98 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  27.93 
 
 
225 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  50.6 
 
 
328 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  39.73 
 
 
221 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
333 aa  55.8  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  27.93 
 
 
775 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  32.28 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  34.34 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.3 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.3 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  47.14 
 
 
511 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30.36 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.3 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30.43 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0006  abortive infection protein  37.65 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  28.87 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.3 
 
 
337 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  36.96 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0006  hypothetical protein  37.65 
 
 
223 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  30.43 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  32.97 
 
 
448 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  30.43 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  32.97 
 
 
448 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  30.43 
 
 
337 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  31.36 
 
 
346 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  26.01 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.6 
 
 
337 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  27.1 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.1 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1789  hypothetical protein  36.62 
 
 
303 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  27.1 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  35 
 
 
343 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  34.68 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  44.93 
 
 
527 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  32.11 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  28.8 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  31.5 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  30 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.14 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  27.1 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  25.49 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  38.2 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  27.62 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.1 
 
 
228 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  34.88 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  38.04 
 
 
318 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  32.04 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  30.7 
 
 
282 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  28.47 
 
 
220 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  31.07 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  30.91 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  31.68 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  32.5 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  26.24 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  32.97 
 
 
453 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  41.98 
 
 
515 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  23.66 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  31.78 
 
 
221 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  32.32 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  32.32 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>