65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4524 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  100 
 
 
285 aa  533  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  51.31 
 
 
275 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  53.31 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  52.85 
 
 
272 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  45.31 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0698  Abortive infection protein  39.7 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  39.33 
 
 
420 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  35.64 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  34.04 
 
 
448 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  38.89 
 
 
448 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  34.65 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  37.08 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.1 
 
 
234 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  37.63 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  30.97 
 
 
453 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.61 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  37.5 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  30.61 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  36.54 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  33.33 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  36.14 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  33.33 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  25.24 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  37.8 
 
 
210 aa  45.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  28.05 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  33.33 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  26.83 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  26.83 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  26.83 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  26.83 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  35.14 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  28.05 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  23.3 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  23.53 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  25.17 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  26.83 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  26.83 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  26.83 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  32.05 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  26.46 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  33.33 
 
 
453 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  36.78 
 
 
452 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  32.18 
 
 
453 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  37.36 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0006  abortive infection protein  36.05 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  38.37 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0006  hypothetical protein  36.05 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  33.33 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  30.48 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  33.01 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  25.61 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  31.07 
 
 
227 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  28.74 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  31.4 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  34.12 
 
 
775 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  33.08 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2393  abortive infection protein  35.85 
 
 
159 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000919744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  29.08 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  26.67 
 
 
228 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  32.98 
 
 
287 aa  42.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>