72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0252 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  100 
 
 		 399 aa  811    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  34 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  34 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  24.85 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  22.31 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  29.78 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  40.24 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  39.02 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  37.8 
 
 		 237 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  39.02 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  41.77 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  36.05 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  38.54 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  34.34 
 
 		 228 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  34.34 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  34.34 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  34.34 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  38.71 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  34.34 
 
 		 228 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  32.99 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  33.94 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  34.48 
 
 		 267 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  32.69 
 
 		 130 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  31.25 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  35 
 
 		 235 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  23.39 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  30.21 
 
 		 527 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  26.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  30.21 
 
 		 527 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  28.46 
 
 		 340 aa  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.87 
 
 		 775 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  31.43 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.65 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  29.2 
 
 		 237 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  32.08 
 
 		 240 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  27.03 
 
 		 273 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  29.17 
 
 		 321 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  36.14 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  32.18 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  29.75 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  28.41 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  31.71 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  31.63 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  32.14 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  32.5 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  29.59 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5144  CAAX amino terminal protease family protein  39.02 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  31.25 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  28.1 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  34.18 
 
 		 238 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  28.69 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  28.69 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  36.05 
 
 		 225 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  28.69 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  28.1 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  28.69 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  31.03 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  28.69 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  28.71 
 
 		 211 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  30.43 
 
 		 538 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  27.18 
 
 		 225 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4711  CAAX amino terminal protease family protein  39.02 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0300594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  23.56 
 
 		 251 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  23.2 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  32.88 
 
 		 269 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4727  CAAX amino terminal protease family protein  39.02 
 
 		 237 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.972237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  29.79 
 
 		 226 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  31.71 
 
 		 250 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  32.89 
 
 		 280 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>