56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0292 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  100 
 
 		 310 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  51.58 
 
 		 317 aa  245  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  47.02 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  41.82 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1789  hypothetical protein  50.2 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00196901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  39.86 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  42.52 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  30.86 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  27.95 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  28.66 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  29.28 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  23.98 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  33.93 
 
 		 538 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  41.18 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  24.12 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  27.08 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  31.82 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  23.57 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  42.25 
 
 		 420 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  31.75 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  28.86 
 
 		 458 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  37.18 
 
 		 480 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  23.62 
 
 		 432 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  38.03 
 
 		 528 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.33 
 
 		 362 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  23.93 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  33.71 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  27.42 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  33.72 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  33.72 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  29.31 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  33.71 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  29.9 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  27.64 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  34.78 
 
 		 527 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0525  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.315028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  32.56 
 
 		 196 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  27.17 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  33.72 
 
 		 511 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  35.21 
 
 		 515 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48029  predicted protein  30 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2373  abortive infection protein  38.36 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1586  Abortive infection protein  37.5 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.099393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1491  Abortive infection protein  37.5 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0494011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  31.37 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  20.37 
 
 		 399 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  29.87 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  25.21 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  30.26 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 		 203 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  33.68 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  34.88 
 
 		 193 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>