111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2995 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  100 
 
 
321 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  42.52 
 
 
299 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  41.71 
 
 
299 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  34.5 
 
 
306 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  40.35 
 
 
302 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  30.79 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  30.26 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  31.85 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  39.36 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  39.17 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  28 
 
 
276 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  35.42 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  33.56 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  32.29 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  34.41 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  34.07 
 
 
187 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  34.07 
 
 
187 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  31.19 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  34.07 
 
 
187 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.29 
 
 
775 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  32.26 
 
 
188 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  34.48 
 
 
187 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  32.26 
 
 
187 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  32.26 
 
 
187 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  32.97 
 
 
187 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  32.26 
 
 
187 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  40.26 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  31.18 
 
 
170 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  32.73 
 
 
234 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  33.33 
 
 
188 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  31.34 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  26.32 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  39.8 
 
 
227 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  30.16 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  30.3 
 
 
201 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  30.21 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  31.48 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  31.48 
 
 
249 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  31.5 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  31.06 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  31.4 
 
 
286 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  32.53 
 
 
211 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  32.53 
 
 
211 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  31.48 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  35.37 
 
 
221 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  30.56 
 
 
249 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  27.19 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4926  Abortive infection protein  37.5 
 
 
198 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.866905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.18 
 
 
228 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.18 
 
 
228 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.18 
 
 
228 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  30.83 
 
 
240 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  30.58 
 
 
237 aa  49.3  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  29.36 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  27.4 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1494  abortive infection protein  41.33 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.81139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  33.33 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  26.26 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  32.14 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  33.78 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  32.91 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  31.16 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  25.13 
 
 
228 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0437  Abortive infection protein  35.35 
 
 
189 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1789  hypothetical protein  43.06 
 
 
303 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196901 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  34.52 
 
 
232 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  29.17 
 
 
399 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  33.64 
 
 
288 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  31.68 
 
 
247 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  31.68 
 
 
247 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  38.04 
 
 
308 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  26.2 
 
 
228 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  28.74 
 
 
244 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  28.83 
 
 
228 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  33.33 
 
 
246 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  37.21 
 
 
285 aa  46.2  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  28.85 
 
 
265 aa  45.8  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  28.85 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  28.44 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  22.76 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  30.77 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  30 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0071  protease  36.71 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  25.76 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  32.11 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  38.75 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  38.75 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  38.75 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  31.73 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  36.59 
 
 
194 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  30.71 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  29.36 
 
 
234 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>