61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0129 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
308 aa  607  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  98.38 
 
 
308 aa  597  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  29.87 
 
 
302 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  34 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  22.53 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  28.8 
 
 
830 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  35.96 
 
 
195 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.93 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  22.81 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  30.3 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  27.78 
 
 
193 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  32.41 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  31.71 
 
 
194 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5434  Abortive infection protein  35.48 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  0.0723746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  27.19 
 
 
193 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  35.71 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  21.54 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  28.57 
 
 
197 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  29.17 
 
 
196 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  28.57 
 
 
197 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  27.88 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  34.12 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  22.44 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  31.19 
 
 
241 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  31.03 
 
 
261 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  28.3 
 
 
200 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  29.84 
 
 
775 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  37.84 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  30 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  31.71 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  30 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  30.7 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  28.48 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  30.7 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  37.76 
 
 
268 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  37.76 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  27.27 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  37.76 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  25.68 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  27.27 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  25.68 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  28.7 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  26.71 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  31.87 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  21.03 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  31.33 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  21.93 
 
 
432 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
221 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  29.81 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  25.53 
 
 
333 aa  42.7  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  29.57 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  26.15 
 
 
244 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  27.59 
 
 
278 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>