125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0959 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  100 
 
 
308 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  50 
 
 
321 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  28.52 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  37.11 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  34.05 
 
 
775 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  28.02 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  26.38 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  34.48 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  36.43 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  32.41 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  43.04 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  32.46 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  27.41 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  33.53 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  24.03 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  29.74 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  35.11 
 
 
246 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  33.56 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  31.05 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  44.58 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  33.06 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1789  hypothetical protein  43.06 
 
 
303 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  22.81 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  22.81 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  41.56 
 
 
538 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  26 
 
 
273 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  41.79 
 
 
453 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  40.3 
 
 
453 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  34.44 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  25.18 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  37.08 
 
 
285 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  25.62 
 
 
313 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  34.65 
 
 
234 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  38.16 
 
 
420 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  25.62 
 
 
313 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  25.44 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2373  abortive infection protein  38.89 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.18 
 
 
234 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1491  Abortive infection protein  38.89 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0494011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1586  Abortive infection protein  38.89 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.099393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  32.62 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  35.56 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  29.11 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1494  abortive infection protein  36.73 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.81139 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  28.92 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  32.94 
 
 
269 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.95 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  23.36 
 
 
337 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  36.78 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  40.3 
 
 
453 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  25.62 
 
 
337 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  26.67 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  27.81 
 
 
432 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35.23 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3241  Abortive infection protein  33.33 
 
 
224 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  24.79 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  24.79 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  24.79 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  32.26 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  35.82 
 
 
527 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  24.79 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  30.68 
 
 
399 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2082  Abortive infection protein  39.71 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17021  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  35.82 
 
 
527 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  24.79 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  35.05 
 
 
180 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  43.04 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  29.46 
 
 
234 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  30.91 
 
 
241 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  27.82 
 
 
515 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  35.51 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  32.43 
 
 
528 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  30.06 
 
 
232 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  32.56 
 
 
420 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  36.49 
 
 
480 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  39.36 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  35.9 
 
 
453 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  24.79 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  31.76 
 
 
242 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  29.87 
 
 
511 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  32.81 
 
 
527 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  31.87 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  36.36 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  28.92 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  33.33 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5434  Abortive infection protein  37.35 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  0.0723746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  36.05 
 
 
228 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  32.47 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  33.33 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  27.93 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  25.22 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  24.14 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  27.88 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  27.85 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  34.29 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  33.71 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  27.63 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  34.72 
 
 
458 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>