90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2471 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  100 
 
 
217 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  52.34 
 
 
216 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  52.34 
 
 
216 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  42.93 
 
 
203 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  42.93 
 
 
203 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  42.41 
 
 
203 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  45.4 
 
 
203 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  45.4 
 
 
203 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  52.99 
 
 
140 aa  138  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  38 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  39 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  38 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  35.51 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  38 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  38 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  38 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  37 
 
 
313 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  35.51 
 
 
337 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  37.25 
 
 
313 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  37.84 
 
 
284 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  42.05 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0016  surface exclusion protien  31.37 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  40.45 
 
 
282 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  42.35 
 
 
346 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  38.83 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  40.45 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  40.91 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  40.45 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  36.08 
 
 
282 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  35.42 
 
 
284 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  35.05 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  35.63 
 
 
319 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  34.38 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  36.28 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  32.26 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  34.58 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  34.29 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  31.82 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  33.71 
 
 
267 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  35.58 
 
 
238 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  31.58 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  35.05 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  33.7 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  32.8 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  35.35 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  31.58 
 
 
262 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  34.41 
 
 
272 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  32 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  34.41 
 
 
480 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  38.64 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  38.95 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  30 
 
 
602 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  32.54 
 
 
453 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2555  abortive infection protein  28.57 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  34.02 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  31.73 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  36.63 
 
 
448 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  36.63 
 
 
448 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  37.11 
 
 
420 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  33.33 
 
 
336 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  36.47 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  34.41 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34.41 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  35.23 
 
 
273 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  30.85 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  34.74 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  34 
 
 
277 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  37.93 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  33.98 
 
 
453 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  25.91 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  34.74 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  30.19 
 
 
279 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  31.63 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  28.72 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  31.71 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  34.04 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  30.39 
 
 
308 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29.27 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  27.78 
 
 
400 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  29.51 
 
 
527 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  29.51 
 
 
527 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  37.35 
 
 
419 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1625  abortive infection protein  34.57 
 
 
414 aa  42.4  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  28.28 
 
 
297 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  30.4 
 
 
225 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  29.14 
 
 
330 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  29.81 
 
 
234 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  27.55 
 
 
288 aa  42  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  28.57 
 
 
528 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>