88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3796 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  100 
 
 
602 aa  1209    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  36.56 
 
 
432 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  32.04 
 
 
237 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 
267 aa  53.9  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  29.27 
 
 
264 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  30.91 
 
 
225 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  37.36 
 
 
301 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.25 
 
 
292 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  39 
 
 
248 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  36.36 
 
 
269 aa  51.2  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  30.77 
 
 
227 aa  50.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  33.33 
 
 
249 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  33.33 
 
 
253 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 
249 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
249 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
249 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 
235 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
249 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
249 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  31.76 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 
249 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  36.08 
 
 
140 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0273  Abortive infection protein  32.08 
 
 
166 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  30.99 
 
 
362 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5410  abortive infection protein  31.21 
 
 
138 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  33.71 
 
 
203 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  33.71 
 
 
203 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  33.71 
 
 
203 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  30.7 
 
 
343 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  29.91 
 
 
225 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  30.34 
 
 
250 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  33.71 
 
 
203 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  31.52 
 
 
244 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  32.56 
 
 
211 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  30.06 
 
 
480 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  34.41 
 
 
226 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  30 
 
 
217 aa  47.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  26.92 
 
 
269 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  35.56 
 
 
225 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  33.71 
 
 
203 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  30 
 
 
244 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  35.56 
 
 
235 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  29.76 
 
 
297 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  31.11 
 
 
249 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  35.71 
 
 
216 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  36 
 
 
282 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  34.52 
 
 
337 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
216 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  31.25 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  30.43 
 
 
272 aa  47  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  32.5 
 
 
236 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  29.65 
 
 
246 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  32.5 
 
 
236 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  32.94 
 
 
291 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.5 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  32.5 
 
 
236 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  29.17 
 
 
528 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  34.44 
 
 
227 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  27.55 
 
 
246 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  40.22 
 
 
213 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  32.53 
 
 
241 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 
337 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.5 
 
 
313 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  33.33 
 
 
211 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  32.5 
 
 
237 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  31.07 
 
 
265 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 
337 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  33.33 
 
 
280 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0071  protease  29.37 
 
 
156 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32.5 
 
 
337 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 
333 aa  44.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  34.67 
 
 
282 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
237 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  31.25 
 
 
238 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  29.76 
 
 
256 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  34.44 
 
 
227 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  31.31 
 
 
245 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  31.31 
 
 
245 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 
225 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  31.87 
 
 
267 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  30.38 
 
 
261 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  29.37 
 
 
210 aa  44.3  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  31.43 
 
 
241 aa  44.3  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.25 
 
 
337 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  31.25 
 
 
337 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  31.58 
 
 
262 aa  43.9  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>