36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0016 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0016  surface exclusion protien  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  37.33 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  35.71 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  42.86 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  33.56 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  33.56 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  33.56 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  32.43 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  33.56 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  32.89 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  35.29 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  35.65 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  28.57 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  27.91 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  27.97 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  28.12 
 
 		 282 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 282 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 284 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  28.83 
 
 		 272 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  25.86 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0406  Abortive infection protein  31.34 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  30.77 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  36.36 
 
 		 528 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  26.67 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0397  Abortive infection protein  31.34 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  36.96 
 
 		 420 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  23.29 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  27.78 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  37.5 
 
 		 237 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  25.27 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  25.66 
 
 		 319 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>