51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  100 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  57.45 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  44.87 
 
 		 238 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  36.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09730  CAAX amino terminal protease family  29.61 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  23.51 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  33.8 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  32.28 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  30.72 
 
 		 420 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  24.58 
 
 		 453 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  32.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  31.11 
 
 		 453 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3231  abortive infection protein  32.31 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  27.49 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  35.79 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  29.59 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  29.45 
 
 		 453 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  27.55 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  38.82 
 
 		 140 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  36.26 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  24.28 
 
 		 448 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  28.48 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  31.11 
 
 		 452 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  24.28 
 
 		 448 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  22.73 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2555  abortive infection protein  34.62 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  38.82 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  38.82 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  34.38 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  23.51 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  23.51 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  33.68 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  34.38 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  33.68 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  23.51 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  32.56 
 
 		 453 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  30.85 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  25.56 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  30.7 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  23.85 
 
 		 337 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  30.23 
 
 		 203 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  34.12 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  30.23 
 
 		 203 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  30.23 
 
 		 203 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>