51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09730  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  31.74 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  31.97 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  29.49 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  38.79 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  41.84 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  36.67 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  31.87 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  36.17 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  28.92 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  31.97 
 
 		 452 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  28.92 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  32.94 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  27.94 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  34.07 
 
 		 140 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  25.6 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  32.93 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  40.24 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  30.12 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  32.97 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  29.27 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  27.78 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.18 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  29.27 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  29.27 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  28.29 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  27.74 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  28.76 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  30.77 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  35.11 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  27.74 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  31.58 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  34.04 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  29.09 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1506  Abortive infection protein  30.97 
 
 		 186 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0652668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  33.7 
 
 		 602 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  35.44 
 
 		 528 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  31.11 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl564  CAAX amino terminal membrane bound protease  30.33 
 
 		 330 aa  42.4  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00292167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  26.62 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3071  Abortive infection protein  35.59 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  38.89 
 
 		 420 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  36.7 
 
 		 193 aa  42.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 		 333 aa  42.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  34.67 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>