46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5928 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  57.45 
 
 		 280 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  42.36 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09730  CAAX amino terminal protease family  42.25 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  32.35 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  35.58 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  30 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  26.26 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  25.74 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  28.7 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  28.87 
 
 		 452 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  28.85 
 
 		 420 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  31.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  31.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  31.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  25.88 
 
 		 453 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  24.62 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  27.15 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  27.04 
 
 		 448 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  26.71 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  27.04 
 
 		 448 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  25.88 
 
 		 453 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  38.96 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  28.75 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  30.23 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  30.23 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  27.93 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  27.93 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.71 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  27.5 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  25.27 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  25.27 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  24.32 
 
 		 527 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  24.32 
 
 		 527 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0136  hypothetical protein  29.35 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  24.3 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  28.05 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  31.25 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  36.71 
 
 		 262 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>