35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2555 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2555  abortive infection protein  100 
 
 		 243 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  34.22 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29.68 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  38.74 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  34.45 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  28.35 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  31.09 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  30.56 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  31.01 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  32.79 
 
 		 140 aa  49.3  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  32.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  32.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  28.57 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  28.57 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  31.33 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  30.95 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  30.95 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  31.07 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  28.1 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  34.62 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  30.39 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  23.81 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  32.29 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  23.81 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  23.81 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  23.81 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  23.81 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  23.81 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  23.81 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  25.93 
 
 		 292 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  32.63 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  25.3 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  29.61 
 
 		 282 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.35 
 
 		 297 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  26.13 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>