20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3247 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  100 
 
 		 264 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  28.51 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  32.94 
 
 		 567 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3280  abortive infection protein  36.32 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4587  protease, CAAX amino terminal family  37 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000987036  normal  0.0574334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  25 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  32.79 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2896  Abortive infection protein  43.37 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.142954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2821  Abortive infection protein  41.11 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3583  abortive infection protein  34.19 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0859  Abortive infection protein  40.24 
 
 		 375 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  35.05 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  32.56 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  32.94 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  23.47 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  39.76 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  34.91 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  34.91 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  34.91 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  38.75 
 
 		 232 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>