52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_679 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  100 
 
 		 242 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  84.71 
 
 		 246 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0773  CAAX amino terminal protease family protein  84.71 
 
 		 246 aa  384  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  37.08 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  29.38 
 
 		 396 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  30.94 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  29.29 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  27.75 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  29.94 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  29.3 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  29.3 
 
 		 170 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2712  Abortive infection protein  33.06 
 
 		 372 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  34.29 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  28.57 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  36.56 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  35.63 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  37.21 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  26.56 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  29.09 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  34.78 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  31.76 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  33.33 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  32.88 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.58 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.58 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.58 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  35.56 
 
 		 180 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3231  abortive infection protein  32.12 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  27.22 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  35.11 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  28 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31340  predicted metal-dependent membrane protease  31.82 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249582  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  37.17 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  32.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  32.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4926  Abortive infection protein  39.56 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.866905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  35.42 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  32.31 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  25.32 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  34.04 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  27.59 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  37.89 
 
 		 362 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0555  abortive infection protein  40.98 
 
 		 330 aa  42.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0657332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  35.06 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  40 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  38.04 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>