27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2427 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  100 
 
 
225 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  49.46 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  39.64 
 
 
255 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  39.64 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  44.06 
 
 
253 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  43.65 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  42.57 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  39.64 
 
 
244 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  39.64 
 
 
244 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  47.85 
 
 
241 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  42.13 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  39.81 
 
 
289 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  39.31 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  46.96 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  38.03 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  29.67 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  40.54 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  40.54 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  40.54 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  31.78 
 
 
140 aa  52  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  31.78 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  31.78 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  30.19 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3149  Abortive infection protein  32.29 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  23.96 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  30.97 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  27.84 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>