39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1205 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  100 
 
 		 258 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  63.82 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  53.23 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  58.13 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  56.8 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  51.65 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  51.24 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  54.03 
 
 		 437 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  54.9 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  48.58 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  49.81 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  48.8 
 
 		 277 aa  198  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  51.87 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  49.79 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  43.31 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  48.19 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  45.96 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  43.78 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  46.25 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  43.9 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  42.86 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  48.28 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  42.58 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  38.61 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  41.94 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  37.84 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  40.6 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  44.03 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  42.58 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  42.58 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  38.22 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  38.22 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  38.67 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  40.77 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31.09 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  32.22 
 
 		 360 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  29.69 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  24.36 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  37.11 
 
 		 265 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>