40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1943 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  100 
 
 
251 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  42.27 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  36.56 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  39.29 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  37.63 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  33.71 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  36.25 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  31.46 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  31.46 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  31.46 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22110  hypothetical protein  32.91 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  31.65 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  30 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  32.58 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  35.06 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  33.33 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  35.79 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  37.63 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  34.74 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  34.74 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  34.74 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  31.87 
 
 
241 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  29.87 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  34.78 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  34.29 
 
 
302 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  31.52 
 
 
286 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  32.14 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  33.33 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  31.11 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  28.98 
 
 
437 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  33.33 
 
 
296 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0175  Abortive infection protein  29.38 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  32.65 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  28.41 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  30.99 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  33.75 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  28.75 
 
 
120 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  26.97 
 
 
258 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  32.61 
 
 
272 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>