26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0004 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  100 
 
 
259 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  31.28 
 
 
241 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  27.43 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  32.24 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3280  abortive infection protein  35.26 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  32.61 
 
 
567 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  32.48 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4587  protease, CAAX amino terminal family  37.78 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000987036  normal  0.0574334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  34.83 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  43.75 
 
 
511 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  27.92 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  30.25 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  35.42 
 
 
528 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  29.41 
 
 
237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  29.41 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  29.41 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  29.41 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  32.97 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0868  Abortive infection protein  29.21 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  37.21 
 
 
120 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  32.58 
 
 
527 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  32.58 
 
 
527 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  36.36 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  44.44 
 
 
527 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3583  abortive infection protein  29.55 
 
 
185 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  34.12 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>