98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1496 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31.73 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  37.88 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  28.38 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  25 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  44.74 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  34.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  35.09 
 
 		 567 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  43.53 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  43.53 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  32.74 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  33.72 
 
 		 313 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  38.67 
 
 		 346 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  33.72 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  33.72 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3280  abortive infection protein  40.59 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  36.14 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  43.66 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  43.66 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  36.84 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  32.98 
 
 		 528 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  37.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  37.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  34.88 
 
 		 527 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  38.46 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  34.88 
 
 		 527 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  38.27 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  35.87 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  32.56 
 
 		 337 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  36.14 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  35.23 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  22.27 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  31.65 
 
 		 396 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  34.88 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  38.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  35.23 
 
 		 308 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  39.33 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  32.53 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  37.08 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  38.67 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  39.33 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  29.2 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  31.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  39.33 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  30.16 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  35.16 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  34.62 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  34.52 
 
 		 775 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  34.52 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0249  Abortive infection protein  48 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  40.24 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  30.43 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  40 
 
 		 511 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.78 
 
 		 362 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  33.75 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  28.99 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  32.14 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  28.26 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  34.12 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  37.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  28.57 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1991  CAAX amino terminal protease family protein  38.54 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  35 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  34.52 
 
 		 515 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2896  Abortive infection protein  31.71 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.142954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1193  abortive infection protein  34.09 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  33.66 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  35 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  38.46 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  36 
 
 		 420 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  33.33 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  32.99 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  27.48 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  27.27 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  36.59 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  34.88 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  28.57 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  29.46 
 
 		 321 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  32.43 
 
 		 343 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3134  abortive infection protein  32.53 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  29.46 
 
 		 432 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.52 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  34.29 
 
 		 527 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  27.52 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  27.52 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>