13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0291 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  100 
 
 		 567 aa  1089    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  34.12 
 
 		 264 aa  88.2  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4587  protease, CAAX amino terminal family  33.2 
 
 		 240 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000987036  normal  0.0574334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3280  abortive infection protein  41.18 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  32.61 
 
 		 259 aa  55.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35.09 
 
 		 241 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3583  abortive infection protein  33.05 
 
 		 185 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.1 
 
 		 2914 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0859  Abortive infection protein  32.73 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  26.79 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  36.17 
 
 		 237 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  36.17 
 
 		 237 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2821  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 340 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>