24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0052 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0052  abortive infection protein  100 
 
 
203 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.184729  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1503  Abortive infection protein  35.91 
 
 
233 aa  98.6  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0802465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1404  Abortive infection protein  35.11 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.352869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0757  abortive infection protein-like  32.68 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3435  Abortive infection protein  30.62 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2513  abortive infection protein  30.94 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2361  abortive infection protein  27.36 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2930  abortive infection protein  34.08 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000197232  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.42 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  24.42 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  24.42 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  26.16 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  28.7 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  30 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  25.58 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  26.79 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  28.19 
 
 
401 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  28.19 
 
 
401 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  27.27 
 
 
279 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3840  abortive infection protein  26.88 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000371681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0364  abortive infection protein  30.46 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3599  abortive infection protein  31.52 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  31.51 
 
 
237 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  34.29 
 
 
273 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>