12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2361 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2361  abortive infection protein  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3435  Abortive infection protein  64.4 
 
 		 216 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2513  abortive infection protein  66.48 
 
 		 217 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2930  abortive infection protein  67.43 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000197232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1404  Abortive infection protein  33.51 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.352869 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0052  abortive infection protein  27.36 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.184729  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1503  Abortive infection protein  30.22 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0802465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0757  abortive infection protein-like  28.96 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0364  abortive infection protein  30.16 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  26.67 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  25.58 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02490  Abortive infection protein  24.04 
 
 		 208 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>