14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02490 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02490  Abortive infection protein  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3840  abortive infection protein  55.39 
 
 		 220 aa  234  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000371681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3599  abortive infection protein  40.78 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2308  abortive infection protein  37.2 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0364  abortive infection protein  38.1 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09056  hypothetical protein  33.72 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.639747  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2184  abortive infection protein  30.84 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.300132  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  37.04 
 
 		 396 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  27.1 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  27.45 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  32.1 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2361  abortive infection protein  24.04 
 
 		 201 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.11 
 
 		 278 aa  41.6  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 267 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>