14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3599 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3599  abortive infection protein  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3840  abortive infection protein  45.1 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000371681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02490  Abortive infection protein  40.78 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2184  abortive infection protein  33.01 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.300132  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2308  abortive infection protein  41.88 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0364  abortive infection protein  33.18 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09056  hypothetical protein  38.6 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.639747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1503  Abortive infection protein  28.81 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0802465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  28.29 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1404  Abortive infection protein  29.09 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.352869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0757  abortive infection protein-like  30.09 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.67 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0052  abortive infection protein  31.52 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.184729  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>