74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1896 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  100 
 
 
260 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  33.86 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  31.5 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  32.28 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  32.28 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  32.28 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  31.5 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  35.65 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  34.75 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  30.97 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  31.61 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  36.96 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  27.46 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  35.11 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  40.23 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  35.11 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  28.12 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  39.34 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  28.12 
 
 
453 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  32.11 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  30.89 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  35.14 
 
 
448 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  35.14 
 
 
448 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  30.34 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  31.11 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  32.33 
 
 
225 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4711  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0300594  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  32 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  26.29 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  35.16 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.39 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  24.58 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5145  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4727  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.972237  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  31 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  28.33 
 
 
241 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.58 
 
 
228 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  24.58 
 
 
228 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  30.63 
 
 
297 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  24.58 
 
 
228 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  28.18 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  34.88 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  28.42 
 
 
211 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  28.65 
 
 
269 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  25 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  28.48 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5144  CAAX amino terminal protease family protein  28.12 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07180  CAAX amino terminal protease family  34.69 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  28.48 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  28.48 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  28.87 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  37.23 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0406  Abortive infection protein  33.33 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  34.52 
 
 
452 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  32.06 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  36.9 
 
 
453 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  27.45 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  29.21 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  32.03 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  32 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  34.69 
 
 
343 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  27.84 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  32.23 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  32.5 
 
 
217 aa  42  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  34.48 
 
 
210 aa  42  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0397  Abortive infection protein  32.35 
 
 
285 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>