31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0006 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0006  abortive infection protein  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0006  hypothetical protein  98.65 
 
 
223 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  47.06 
 
 
278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  47.54 
 
 
281 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  36.22 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  36.17 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  36.17 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  30.16 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  33.65 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  36.26 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  32.73 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  36.47 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  29.73 
 
 
221 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  34.78 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  25.29 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  35.9 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  35.85 
 
 
321 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  25.95 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  29.7 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.69 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  35.96 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  26.48 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  24.86 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  30.28 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  28.4 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  30.28 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  33.64 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  29.71 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  35.48 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  26.43 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  32.98 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>