28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3591 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3591  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 563 aa  1083    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0938  CAAX prenyl protease-related protein  34.83 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0941  CAAX prenyl protease-related protein  35.27 
 
 		 548 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0234023  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2030  abortive infection protein  28.05 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.691955  normal  0.718328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1797  CAAX amino terminal protease family protein  29.63 
 
 		 219 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1765  CAAX prenyl protease-related protein  26.84 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2482  CAAX prenyl protease-related protein  32.84 
 
 		 237 aa  67  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3086  abortive infection protein  31.88 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2431  abortive infection protein  25.89 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.704048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0824  CAAX amino terminal protease family protein  27.03 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2233  CAAX prenyl protease-related protein  25.45 
 
 		 228 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000816871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2368  abortive infection protein  23.29 
 
 		 237 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1991  CAAX amino terminal protease family protein  26.18 
 
 		 242 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0695  CAAX prenyl protease-related protein  29.68 
 
 		 236 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.269499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2036  abortive infection protein  23.98 
 
 		 228 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000200471  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  35.05 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  42.71 
 
 		 521 aa  49.7  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  35.05 
 
 		 216 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  35.05 
 
 		 216 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  35.37 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  39.13 
 
 		 235 aa  47.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  29.41 
 
 		 266 aa  47  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  32.08 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  34.07 
 
 		 343 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  32.93 
 
 		 264 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  34.04 
 
 		 338 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  40.2 
 
 		 279 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  32.63 
 
 		 284 aa  43.5  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>