53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1797 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1797  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2030  abortive infection protein  50.68 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.691955  normal  0.718328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0824  CAAX amino terminal protease family protein  37.72 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2368  abortive infection protein  35.09 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2233  CAAX prenyl protease-related protein  38.29 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000816871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2036  abortive infection protein  34.84 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000200471  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2431  abortive infection protein  37.23 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.704048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1991  CAAX amino terminal protease family protein  36.77 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2482  CAAX prenyl protease-related protein  35.09 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1765  CAAX prenyl protease-related protein  35.09 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3086  abortive infection protein  38.97 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0695  CAAX prenyl protease-related protein  35.19 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.269499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  27.27 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3591  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0938  CAAX prenyl protease-related protein  36.75 
 
 		 548 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  36.36 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  28.43 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0103  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0941  CAAX prenyl protease-related protein  38.1 
 
 		 548 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0234023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30.11 
 
 		 313 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  28.3 
 
 		 337 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 337 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  27.87 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  28.3 
 
 		 337 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.11 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30.11 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  30.77 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  30.11 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  28.87 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  30.11 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  29.55 
 
 		 264 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0071  protease  32.61 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  32.35 
 
 		 312 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5410  abortive infection protein  32.95 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  35.71 
 
 		 299 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  28.46 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  20.51 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  25.89 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  24.59 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  29.37 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  32.16 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  29.9 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  31.31 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  26.92 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  37.5 
 
 		 273 aa  42  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  33.66 
 
 		 257 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>