35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1765 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1765  CAAX prenyl protease-related protein  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2482  CAAX prenyl protease-related protein  89.03 
 
 		 237 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2431  abortive infection protein  52.49 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.704048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2368  abortive infection protein  47.81 
 
 		 237 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2233  CAAX prenyl protease-related protein  46.96 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000816871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2036  abortive infection protein  43.81 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000200471  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1991  CAAX amino terminal protease family protein  40.72 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0824  CAAX amino terminal protease family protein  38.6 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3086  abortive infection protein  39.57 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0695  CAAX prenyl protease-related protein  37.17 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.269499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2030  abortive infection protein  35.78 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.691955  normal  0.718328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1797  CAAX amino terminal protease family protein  35.09 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0938  CAAX prenyl protease-related protein  35.58 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  29.19 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.19 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  30 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  28.66 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3591  CAAX amino terminal protease family protein  26.84 
 
 		 563 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  29.38 
 
 		 337 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  27.95 
 
 		 337 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0941  CAAX prenyl protease-related protein  35.58 
 
 		 548 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0234023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  29.78 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0890  abortive infection protein  32.18 
 
 		 547 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327179  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1772  Abortive infection protein  30.11 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00799126  normal  0.40287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  28.79 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  28.85 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  29.67 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  29.67 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  31.52 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  31.52 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>