55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2468 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  100 
 
 
317 aa  610  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  46.67 
 
 
276 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2712  Abortive infection protein  36.69 
 
 
372 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  33.33 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  31.23 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  31.03 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  32.8 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  28.57 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  36.02 
 
 
251 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  31.06 
 
 
251 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2288  Abortive infection protein  39.47 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  30.88 
 
 
321 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  27.06 
 
 
187 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  27.06 
 
 
187 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  27.06 
 
 
187 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  31.58 
 
 
272 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  32.63 
 
 
198 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  27.06 
 
 
188 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  26.47 
 
 
170 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  29.48 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2082  Abortive infection protein  36.09 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17021  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  28.47 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  30.65 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  28.47 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  28.47 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  28.47 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  31.07 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22120  CAAX amino terminal protease family  31.96 
 
 
254 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  32.94 
 
 
187 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0525  hypothetical protein  27.68 
 
 
255 aa  46.6  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.315028  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  34.78 
 
 
242 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  30.21 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  30.91 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  33.01 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  28 
 
 
775 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  26.5 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  38.1 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  34.38 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  30.77 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.91 
 
 
278 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  28.71 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  28.71 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  28.71 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  29.82 
 
 
193 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  29.81 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  33.98 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  31.37 
 
 
188 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  25.76 
 
 
234 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  26.89 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  28.06 
 
 
308 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  25.87 
 
 
235 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0966  immunity protein PlnI  31.87 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0817583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  25.84 
 
 
317 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>