30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3350 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  26.37 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  25.7 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  27.54 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  25.23 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  27.59 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  28.33 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  33.98 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  33.98 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  33.98 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  26.01 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  31.78 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  26.01 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  26.01 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  26.01 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  26.01 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  26.01 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  26.01 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  25.98 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  30 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  25.87 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  34.78 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  24.79 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  36.73 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  29.52 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  29.81 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  28.72 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  22.9 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>